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Accès ouvert déclaré 2022 article

Draft genome of the aardaker (Lathyrus tuberosus L.), a tuberous legume

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Résumé fourni par la source

OBJECTIVES: Lathyrus tuberosus is a nitrogen-fixing member of the Fabaceae which forms protein-rich tubers. To aid future domestication programs for this legume plant and facilitate evolutionary studies of tuber formation, we have generated a draft genome assembly based on Pacific Biosciences sequence reads. DATA DESCRIPTION: Genomic DNA from L. tuberosus was sequenced with PacBio's HiFi sequencing chemistry generating 12.8 million sequence reads with an average read length of 14 kb (approximately 180 Gb of sequence data). The reads were assembled to give a draft genome of 6.8 Gb in 1353 contigs with an N50 contig length of 11.1 Mb. The GC content of the genome assembly was 38.3%. BUSCO analysis of the genome assembly indicated a genome completeness of at least 96%. The genome sequence will be a valuable resource, for example, in assessing genomic consequences of domestication efforts and developing marker sets for breeding programs. The L. tuberosus genome will also aid in the analysis of the evolutionary history of plants within the nitrogen-fixing Fabaceae family and in understanding the molecular basis of tuber evolution.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
Draft genome of the aardaker (Lathyrus tuberosus L.), a tuberous legume
Date Crossref
04/09/2022
Éditeur
Springer Science and Business Media LLC
Type
journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude et ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Institutions déclarées

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Sujets associés

Legume Nitrogen Fixing SymbiosisGenomics and Phylogenetic StudiesGenetic and Environmental Crop Studies

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