The genus Serratia revisited by genomics
Rattachement africain : gb, fr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
The genus Serratia has been studied for over a century and includes clinically-important and diverse environmental members. Despite this, there is a paucity of genomic information across the genus and a robust whole genome-based phylogenetic framework is lacking. Here, we have assembled and analysed a representative set of 664 genomes from across the genus, including 215 historic isolates originally used in defining the genus. Phylogenomic analysis of the genus reveals a clearly-defined population structure which displays deep divisions and aligns with ecological niche, as well as striking congruence between historical biochemical phenotyping data and contemporary genomics data. We highlight the genomic, phenotypic and plasmid diversity of Serratia, and provide evidence of different patterns of gene flow across the genus. Our work provides a framework for understanding the emergence of clinical and other lineages of Serratia.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- The genus Serratia revisited by genomics
- Date Crossref
- 03/09/2022
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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University of Dundee pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Wellcome Sanger Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Inserm pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Institut Pasteur Unité Biodiversité des Bactéries Pathogènes Emergentes pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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European Bioinformatics Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Wellcome Trust pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Université Paris Cité pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institut Necker Enfants Malades pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Toulouse NeuroImaging Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of St Andrews pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Liverpool School of Tropical Medicine Departments of Vector Biology and Clinical Sciences pays non établi dans la noticeOrganisme public
University of Dundee, Wellcome Sanger Institute et Inserm, avec 9 autres affiliations.
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