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FIND-IT: Accelerated trait development for a green evolution

Søren Knudsen, Toni Wendt, Christoph Dockter, Hanne Cecilie Thomsen, Magnus Wohlfahrt Rasmussen, Morten Egevang Jørgensen, Qiongxian Lu, Cynthia Voss, Emiko Murozuka, Jeppe Thulin Østerberg, Jesper Harholt, Ilka Braumann, J.A. Cuesta-Seijo, Sandip Mallikarjun Kale, Sabrina Bodevin, Lise Tang Petersen, Massimiliano Carciofi, Pai Pedas, Jeppe Opstrup Husum, Martin Toft Simmelsgaard Nielsen, Kasper Rene Nielsen, Mikkel K. Jensen, Lillian A. Møller, Zoran Gojković, Alexander Striebeck, Klaus B. Lengeler, Ross T. Fennessy, Michael Jay Katz, Rosa García Sánchez, Natalia Solodovnikova, Jochen Förster, Ole Olsen, Birger Lindberg Møller, Geoffrey B. Fincher, Birgitte Skadhauge

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3Institutions déclarées

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Rattachement africain : dk, au. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Improved agricultural and industrial production organisms are required to meet the future global food demands and minimize the effects of climate change. A new resource for crop and microbe improvement, designated FIND-IT (Fast Identification of Nucleotide variants by droplet DigITal PCR), provides ultrafast identification and isolation of predetermined, targeted genetic variants in a screening cycle of less than 10 days. Using large-scale sample pooling in combination with droplet digital PCR (ddPCR) greatly increases the size of low–mutation density and screenable variant libraries and the probability of identifying the variant of interest. The method is validated by screening variant libraries totaling 500,000 barley ( Hordeum vulgare ) individuals and isolating more than 125 targeted barley gene knockout lines and miRNA or promoter variants enabling functional gene analysis. FIND-IT variants are directly applicable to elite breeding pipelines and minimize time-consuming technical steps to accelerate the evolution of germplasm.

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Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref: FIND-IT: Accelerated trait development for a green evolution
Date Crossref: 26/08/2022
Éditeur: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
Type: journal-article

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Où se fait cette recherche

Carlsberg Laboratory pays non établi dans la notice
Structure de recherche
University of Copenhagen Plant Biochemistry Laboratory pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Australian Research Council pays non établi dans la notice
Organisme public
Carlsberg Research Laboratory pays non établi dans la notice
Structure de recherche

Carlsberg Laboratory, Plant Biochemistry Laboratory — University of Copenhagen et Australian Research Council, avec 1 autre affiliation.

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