Accès ouvert déclaré 2022 article

Clonal somatic copy number altered driver events inform drug sensitivity in high-grade serous ovarian cancer

Filipe Correia Martins, Dominique‐Laurent Couturier, Ines de Santiago, Carolin M. Sauer, Maria Vias, Mihaela Angelova, Deborah A. Sanders, Anna Piskorz, James Hall, Karen Hosking, Anumithra Amirthanayagam, Sabina Cosulich, Larissa S. Carnevalli, Barry R. Davies, Thomas B.K. Watkins, Ionut G. Funingana, Helen Bolton, Krishnayan Haldar, John Latimer, Peter Baldwin, Robin Crawford, Matthew Eldridge, Bristi Basu, Mercedes Jimenez-Linan, Andrew McPherson, Nicholas McGranahan, Kevin Litchfield, Sohrab P. Shah, Iain A. McNeish, Carlos Caldas, Gérard I. Evan, Charles Swanton, James D. Brenton

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The R markdown document MartinsEtAl-Code-Zenodo.Rmd contains the R code used to generate statistical results - like estimates, tests and p-values - presented in the manuscript Somatic chromosomal number alterations affecting driver genes inform in-vitro and clinical drug response in high-grade serous ovarian cancer of Martins et al (2022). The required data input files are available in the zip file MartinsEtAl-InputFiles.zip. The pdf file MartinsEtAl-Code-Zenodo.pdf shows the compiled output. Several minutes are required to produce the html/pdf output due to the use of resampling based inference.

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