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Accès ouvert déclaré 2022 preprint

Comprehensive chromatin proteomics resolves functional phases of pluripotency

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7Institutions déclarées
3Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : de, nl, dk. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Abstract The establishment of cellular identity is driven by transcriptional and epigenetic regulation exerted by the components of the chromatin proteome - the chromatome. However, chromatome composition and its dynamics in functional phases of pluripotency have not been comprehensively analyzed thus limiting our understanding of these processes. To address this problem, we developed an accurate mass spectrometry (MS)-based proteomic method called Chromatin Aggregation Capture (ChAC) followed by Data-Independent Acquisition (DIA) to analyze chromatome reorganizations during the transition from ground to formative and primed pluripotency states. This allowed us to generate a comprehensive atlas of proteomes, chromatomes, and chromatin affinities for the three pluripotency phases, revealing the specific binding and rearrangement of regulatory complexes. The technical advances, the comprehensive chromatome atlas, and the extensive analysis reported here provide a foundation for an in-depth understanding of mechanisms that govern the phased progression of pluripotency and changes of cellular identities in development and disease.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
Comprehensive chromatin proteomics resolves functional phases of pluripotency
Date Crossref
08/08/2022
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • Max Planck Institute of Biochemistry Department of Proteomics and Signal Transduction pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Ludwig-Maximilians-Universität München pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Helmholtz Munich pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Leiden University Leiden Academic Centre for Drug Research (LACDR) pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Centre for Human Drug Research pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • University of Copenhagen Proteomics Research Infrastructure pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Novo Nordisk Foundation pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Faculty of Biology and Center for Molecular Biosystems (BioSysM) pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Institute of Stem Cell Research pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Faculty of Health Sciences Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure

Department of Proteomics and Signal Transduction — Max Planck Institute of Biochemistry, Ludwig-Maximilians-Universität München et Helmholtz Munich, avec 7 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

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