Accès ouvert déclaré 2022 preprint

Outcomes of laboratory-confirmed SARS-CoV-2 infection during resurgence driven by Omicron lineages BA.4 and BA.5 compared with previous waves in the Western Cape Province, South Africa

Mary‐Ann Davies, Erna Morden, Petro Rosseau, Juanita O. Arendse, Jamy‐Lee Bam, Linda Boloko, Keith Cloete, Cheryl A. Cohen, Nicole Chetty, Pierre Dane, Alexa Heekes, Marvin Hsiao, Mehreen B Hunter, Hannah Sophia Hussey, Theuns Jacobs, Waasila Jassat, Saadiq Kariem, Reshma Kassanjee, Inneke Laenen, Sue Le Roux, Richard J. Lessells, Hassan Mahomed, Deborah Maughan, Graeme Meintjes, Marc Mendelson, Ayanda Trevor Mnguni, Melvin Moodley, Katy Murie, Jonathan Naudé, Ntobeko Ntusi, Masudah Paleker, Arifa Parker, David C Pienaar, Wolfgang Preiser, Hans Walter Prozesky, Peter Raubenheimer, Liezel Rossouw, Neshaad Schrueder, Barry Smith, Mariette Smith, Wesley Solomon, Greg Symons, Jantjie Taljaard, Sean A Wasserman, Robert John Wilkinson, Milani Wolmarans, Nicole Wolter, Andrew Boulle

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13Institutions déclarées

2Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : Afrique du Sud, gb. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Objective: We aimed to compare clinical severity of Omicron BA.4/BA.5 infection with BA.1 and earlier variant infections among laboratory-confirmed SARS-CoV-2 cases in the Western Cape, South Africa, using timing of infection to infer the lineage/variant causing infection. Methods: We included public sector patients aged ≥20 years with laboratory-confirmed COVID-19 between 1-21 May 2022 (BA.4/BA.5 wave) and equivalent prior wave periods. We compared the risk between waves of (i) death and (ii) severe hospitalization/death (all within 21 days of diagnosis) using Cox regression adjusted for demographics, comorbidities, admission pressure, vaccination and prior infection. Results: Among 3,793 patients from the BA.4/BA.5 wave and 190,836 patients from previous waves the risk of severe hospitalization/death was similar in the BA.4/BA.5 and BA.1 waves (adjusted hazard ratio [aHR] 1.12; 95% confidence interval [CI] 0.93; 1.34). Both Omicron waves had lower risk of severe outcomes than previous waves. Prior infection (aHR 0.29, 95% CI 0.24; 0.36) and vaccination (aHR 0.17; 95% CI 0.07; 0.40 for boosted vs. no vaccine) were protective. Conclusion: Disease severity was similar amongst diagnosed COVID-19 cases in the BA.4/BA.5 and BA.1 periods in the context of growing immunity against SARS-CoV-2 due to prior infection and vaccination, both of which were strongly protective.

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Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref: Outcomes of laboratory-confirmed SARS-CoV-2 infection during resurgence driven by Omicron lineages BA.4 and BA.5 compared with previous waves in the Western Cape Province, South Africa
Date Crossref: 28/06/2022
Éditeur: openRxiv
Type: posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

Western Cape Department of Health Western Cape Department of Health, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
Organisme public
University of Cape Town Department of Medicine University of Cape Town, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
Université ou école supérieure
Groote Schuur Hospital Western Cape, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
Établissement de santé
National Health Laboratory Service Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
Organisme public
University of the Witwatersrand University of the Witwatersrand, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
Université ou école supérieure
Stellenbosch University Department of Medicine Stellenbosch University, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
Université ou école supérieure
Karl Bremer Hospital Western Cape, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
Établissement de santé
University of KwaZulu-Natal Innovation & Sequencing Platform University of KwaZulu-Natal, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
Université ou école supérieure
South African Medical Research Council Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
Institution
Tygerberg Hospital Western Cape, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
Établissement de santé
The Francis Crick Institute pays non établi dans la notice
Structure de recherche
Wellcome Centre for Infectious Diseases Research in Africa Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
Structure de recherche

Western Cape Department of Health (Western Cape Department of Health, Afrique du Sud), Department of Medicine — University of Cape Town (University of Cape Town, Afrique du Sud) et Groote Schuur Hospital (Western Cape, Afrique du Sud), avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Afrique du Sud.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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