The Pseudo-Torsional Space of RNA
Rattachement africain : uy, es. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
ABSTRACT The characterization of the conformational landscape of the RNA backbone is rather complex due to the ability of RNA to assume a big variety of conformations. These backbone conformations can be depicted by pseudo-torsional angles linking RNA backbone atoms, from which Ramachandran-like plots can be built. We explored here different definitions of these pseudo-torsional angles, finding that the most accurate ones are the traditional η (eta) and θ (theta) angles, which represent the relative position of RNA backbone atoms P and C4’. We explore the distribution of η-θ in known experimental structures, comparing the pseudo-torsional space generated with structures determined exclusively by one experimental technique. We found that the complete picture only appears when combining data from different sources. The maps provide a quite comprehensive representation of the RNA accessible space, which can be used in RNA-structural prediction. Finally, our results highlight that protein interactions leads to significant changes in the population of the η-θ space, pointing towards the role of induced-fit mechanisms in protein-RNA recognition.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- The Pseudo-Torsional Space of RNA
- Date Crossref
- 28/06/2022
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Universidad de la República de Uruguay pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institut Pasteur de Montevideo pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institute for Research in Biomedicine Molecular Modelling and Bioinformatics Group pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Universitat de Barcelona pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Computational Biophysics Group pays non établi dans la noticeInstitution
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Functional Genomics Laboratory pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Faculty of Biology Department of Biochemistry and Molecular Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Universidad de la República de Uruguay, Institut Pasteur de Montevideo et Molecular Modelling and Bioinformatics Group — Institute for Research in Biomedicine, avec 4 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.