The dynseq genome browser track enables visualization of context-specific, dynamic DNA sequence features at single nucleotide resolution
Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract We introduce the dynseq genome browser track, which displays DNA nucleotide characters scaled by user-specified, base-resolution scores provided in the BigWig file format. The dynseq track enables visualization of context-specific, informative genomic sequence features. We demonstrate its utility in three popular genome browsers for interpreting cis-regulatory sequence syntax and regulatory variant interpretation by visualizing nucleotide importance scores derived from machine learning models of regulatory DNA trained on protein-DNA binding and chromatin accessibility experiments.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- The dynseq genome browser track enables visualization of context-specific, dynamic DNA sequence features at single nucleotide resolution
- Date Crossref
- 28/05/2022
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Stanford University Department of Computer Science pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Washington University in St. Louis Department of Genetics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
University of California Genomics Institute pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
The Harker School pays non établi dans la noticeInstitution
-
Reservoir Genomics LLC pays non établi dans la noticeInstitution
-
Ozette Technologies pays non établi dans la noticeInstitution
Department of Computer Science — Stanford University, Department of Genetics — Washington University in St. Louis et Genomics Institute — University of California, avec 3 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.