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Accès ouvert déclaré 2020 preprint

In-Source CID Ramping (InCIDR) and Co-Variant Ion Analysis of Hydrophilic Interaction Chromatography (HILIC) Metabolomics

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Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

A large proportion of the complexity and redundancy of LC-MS metabolomics data comes from adduct formation. To reduce such redundancy, many tools have been developed to recognize and annotate adduct ions. These tools rely on pre-defined adduct lists which are learned empirically from reverse phase LC-MS studies. Meanwhile, hydrophilic interaction chromatography (HILIC) is gaining popularity in metabolomics studies due to better performance on polar compounds. HILIC methods typically use high concentration of buffer salts for improved chromatography performance. It is therefore necessary to analyze the adduct formation in HILIC metabolomics. To this end, we developed co-variant ion analysis (COVINA) to investigate the metabolite adduct formation. Using this tool, we completely annotated 201 adduct and fragment ions of 10 metabolites. Many of the metabolite adduct ions are found to contain cluster ions of mobile phase additives. We further utilized COVINA to find the major ionization forms of metabolites. Our results show that for some metabolites the adduct ion signals can be >200-fold higher than the deprotonated form, offering better sensitivity for targeted metabolomics analysis. Finally, we developed the in-source CID ramping (InCIDR) method to analyze the intensity changes of the adduct and fragment ions of the metabolites. Our analysis demonstrates a promising method to distinguish the protonated/deprotonated ions of the metabolites from the adduct and fragment ions.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
In-Source CID Ramping (InCIDR) and Co-Variant Ion Analysis of Hydrophilic Interaction Chromatography (HILIC) Metabolomics
Date Crossref
23/01/2020
Éditeur
American Chemical Society (ACS)
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • The State University of New Jersey Rutgers pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Rutgers Cancer Institute pays non établi dans la notice
    Établissement de santé
  • Environmental and Occupational Health Sciences Institute pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Johnson University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • The Ohio State University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Rutgers University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Ernest Mario School of Pharmacy . Department of Chemical Biology pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • . Department of Medicine pays non établi dans la notice
    Institution
  • College of Public Health . Division of Biostatistics pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure

Rutgers — The State University of New Jersey, Rutgers Cancer Institute et Environmental and Occupational Health Sciences Institute, avec 6 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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