Accès ouvert déclaré 2021 preprint

Genome-wide oscillations in G + C density and sequence conservation

Zarmik Moqtaderi, Susan Jayne Brown, Welcome W. Bender

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3Institutions déclarées

1Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Eukaryotic genomes typically show a uniform G + C content among chromosomes, but on smaller scales, many species have a G + C density that fluctuates with a characteristic wavelength. This oscillation is evident in many insect species, with wavelengths ranging between 700 bp and 4 kb. Measures of evolutionary conservation oscillate in phase with G + C content, with conserved regions having higher G + C. Loci with large regulatory regions show more regular oscillations; coding sequences and heterochromatic regions show little or no oscillation. There is little oscillation in vertebrate genomes in regions with densely distributed mobile repetitive elements. However, species with few repeats show oscillation in both G + C density and sequence conservation. These oscillations may reflect optimal spacing of cis-regulatory elements.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref: Genome-wide oscillations in G + C density and sequence conservation
Date Crossref: 14/10/2021
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
Type: journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

Harvard University pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Boston VA Research Institute pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
Kansas State University Department of Biology pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Blavatnik Institute Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology pays non établi dans la notice
Structure de recherche

Harvard University, Boston VA Research Institute et Department of Biology — Kansas State University, avec 1 autre affiliation.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

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