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Accès ouvert déclaré 2021 preprint

A quantitative mapping approach to identify direct interactions within complexomes

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Rattachement africain : at, de, us, be, fr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

ABSTRACT Complementary methods are required to fully characterize all protein complexes, or the complexome, of a cell. Affinity purification coupled to mass-spectrometry (AP-MS) can identify the composition of complexes at proteome-scale. However, information on direct contacts between subunits is often lacking. In contrast, solving the 3D structure of protein complexes can provide this information, but structural biology techniques are not yet scalable for systematic, proteome-wide efforts. Here, we optimally combine two orthogonal high-throughput binary interaction assays, LuTHy and N2H, and demonstrate that their quantitative readouts can be used to differentiate direct interactions from indirect associations within multiprotein complexes. We also show that LuTHy allows accurate distance measurements between proteins in live cells and apply these findings to study the impact of the polyglutamine expansion mutation on the structurally unresolved N-terminal domain of Huntingtin. Thus, we present a new framework based on quantitative interaction assays to complement structural biology and AP-MS techniques, which should help to provide first-approximation contact maps of multiprotein complexes at proteome-scale. Graphical Abstract

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
A quantitative mapping approach to identify direct interactions within complexomes
Date Crossref
26/08/2021
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • Institute of Molecular Biotechnology Brain Development and Disease pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Austrian Academy of Sciences pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • Max Delbrück Center pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Harvard University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Boston VA Research Institute pays non établi dans la notice
    Organisation à but non lucratif
  • Dana-Farber Cancer Institute Center for Cancer Systems Biology (CCSB) pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • University of Liège Laboratory of Viral Interactomes pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • Institut Pasteur pays non établi dans la notice
    Organisation à but non lucratif
  • Université Paris Cité pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Department of Virology pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Fraunhofer Institute for Applied Polymer Research Multifunctional Colloids and Coating pays non établi dans la notice
    Structure de recherche

Brain Development and Disease — Institute of Molecular Biotechnology, Austrian Academy of Sciences et Max Delbrück Center, avec 9 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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