Dicer-like, Argonauta és RNS-függő RNS polimeráz géncsaládok azonosítása árpában (Hordeum vulgare l.) és lehetséges szerepük a növényi stresszválaszban
Résumé fourni par la source
A kis szabályozó RNS molekulákra épülő RNS interferencia (RNSi) minden eukarióta élőlényben megtalálható géncsendesítési mechanizmus, mely megnyilvánulhat poszt-transzkripciós (PTGS: Post Trascriptional Gene Silencing) és transzkripciós (TGS: Transcriptional Gene Silencing) szinteken. Szerepe a növényekben sokrétű, az egyedfejlődéstől (vegetatív szervek kialakulása, virágzás, termésérés) a környezetre adott válaszreakciókon át (biotikus- és abiotikus stresszválasz) a genomstabilitásig (mobilis genetikai elemek féken tartása) szinte minden élettani folyamat szabályozásában részt vesz. Kulcsszereplői a kis RNS-ek képződését és érését katalizáló Dicer-like- (DCL), a folyamatok végrehajtásában résztvevő Argonauta- (AGO) és a jelsokszorosításért felelő RNS-függő RNS polimeráz (RDR) fehérjék. A molekuláris biológiai modellnövény Arabidopsis thalianában, valamint a gazdasági jelentőséggel is bíró rizsben, kukoricában, paradicsomban, olasz muharban és szőlőben már számos tagját leírták és jellemezték az előbb megnevezett fehérjéket kódoló géncsaládoknak. Ezzel szemben árpa RNSi „gépezetéről” - bár genomja 2012 óta ismert és a negyedik legnagyobb mennyiségben termesztett gabonaféleként tartják számon – eddig nem született hasonló átfogó tanulmány. Kutatócsoportunk célja a feltételezett árpa AGO, DCL és RDR gének bioinformatikai módszerekkel történő azonosítása, evolúciós rokonsági kapcsolataik feltárása, expressziójuk vizsgálata különböző szövettípusokban és stresszhatásokra, valamint az általuk kódolt fehérjék funkciójának megismerése. Eddigi eredményeink arra engednek következtetni, hogy az árpa genom által kódolt 10 feltételezett AGO, 5 feltételezett DCL és 7 feltételezett RDR fehérje, méretében, doménszerkezetében és filogenetikai kapcsolatrendszerében nagyban hasonlít a megfelelő Arabidopsis és rizs ortológokhoz. Kódoló génjeik promóterrégiója számos olyan motívumot tartalmaz, melyek sztesszválaszban betöltött szerepükre utal. Az in silico eredmények igazolására elsősorban abiotikus stressznek (hő, szárazság) kitett árpanövények mintáiban vizsgáljuk az általunk azonosított RNSi komponensek génexpressziós változásait.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.