Identification of CRF89_BF, a new member of an HIV-1 circulating BF intersubtype recombinant form family widely spread in South America
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Le résumé fourni par la source
Circulating recombinant forms (CRFs) contribute substantially to the HIV-1 pandemic. Among 105 CRFs described in the literature, 16 are BF intersubtype recombinants, most of South American origin, of which CRF12_BF is the most widely spread. A BF recombinant cluster identified in Bolivia was suggested to represent a new CRF_BF. Here we find that it belongs to a larger cluster incorporating 39 viruses collected in 7 countries from 3 continents, 22 of them in Spain, most from Bolivian or Peruvian individuals, and 12 in South America (Bolivia, Argentina, and Peru). This BF cluster comprises three major subclusters, two associated with Bolivian and one with Peruvian individuals. Near full-length genome sequence analyses of nine viruses, collected in Spain, Bolivia, and Peru, revealed coincident BF mosaic structures, with 13 breakpoints, 6 and 7 of which coincided with CRF12_BF and CRF17_BF, respectively. In a phylogenetic tree, they grouped in a clade closely related to these CRFs, and more distantly to CRF38_BF and CRF44_BF, all circulating in South America. These results allowed to identify a new HIV-1 CRF, designated CRF89_BF. Through phylodynamic analyses, CRF89_BF emergence was estimated in Bolivia around 1986. CRF89_BF is the fifth CRF member of the HIV-1 recombinant family related to CRF12_BF.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Identification of CRF89_BF, a new member of an HIV-1 circulating BF intersubtype recombinant form family widely spread in South America
- Date Crossref
- 01/06/2021
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Instituto de Salud Carlos III Centro Nacional de Microbiología pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Centro Nacional de Microbiologia pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Milken Institute Department of Biostatistics and Bioinformatics pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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George Washington University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Complejo Hospitalario de Navarra pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Hospital Universitario Araba pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
Centro Nacional de Microbiología — Instituto de Salud Carlos III, Centro Nacional de Microbiologia et Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública, avec 9 autres affiliations.
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