Analytical Validation of an Error-Corrected Ultra-Sensitive Ctdna Next-Generation Sequencing Assay
Rattachement africain : au. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Plasma circulating tumor DNA (ctDNA) analysis has emerged as a minimally invasive means to perform molecular tumor typing. Here we developed a custom ultra-sensitive ctDNA next-generation sequencing assay using molecular barcoding technology and off-the-shelf reagents combined with bioinformatics tools for enhanced ctDNA analysis. Assay performance was assessed via a spike-in experiment and the technique was applied to analyze 41 plasma samples from men with advanced prostate cancer. Orthogonal validation was performed using a commercial assay. Sensitivity and specificity of 93 and 99.5% were recorded for ultra-rare somatic variants (<1%), with high concordance observed between the in-house and commercial assays. The optimized protocol dramatically improved the efficiency of the assay and enabled the detection of low-frequency somatic variants from plasma cell-free DNA (cfDNA).
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Analytical Validation of an Error-Corrected Ultra-Sensitive Ctdna Next-Generation Sequencing Assay
- Date Crossref
- 13/07/2020
- Éditeur
- Informa UK Limited
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Monash University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Monash Health Precision Medicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
Peter MacCallum Cancer Centre pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
The University of Melbourne Sir Peter MacCallum Department of Oncology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research Walter & pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
Cancer Council Victoria pays non établi dans la noticeOrganisme public
-
School of Clinical Sciences Department of Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Department of Medical Oncology pays non établi dans la noticeInstitution
-
Cancer Research Division pays non établi dans la noticeInstitution
-
Computational Cancer Biology Program pays non établi dans la noticeInstitution
-
Cancer Epidemiology Division pays non établi dans la noticeInstitution
Monash University, Precision Medicine — Monash Health et Peter MacCallum Cancer Centre, avec 8 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.