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Accès ouvert déclaré 2019 preprint

Assessing the shared variation among high-dimensional data matrices: a modified version of the Procrustean correlation coefficient

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Résumé fourni par la source

Abstract Motivation Molecular biology and ecology studies can produce high dimension data. Estimating correlations and shared variation between such data sets are an important step in disentangling the relationships between different elements of a biological system. Unfortunately, classical approaches are susceptible to producing falsely inferred correlations. Results Here we propose a corrected version of the Procrustean correlation coefficient that is robust to high dimensional data. This allows for a correct estimation of the shared variation between two data sets and the partial correlation coefficients between a set of matrix data. Availability The proposed corrected coefficients are implemented in the ProcMod R package available on CRAN. The git repository is hosted at https://git.metabarcoding.org/lecasofts/ProcMod Contact eric.coissac@metabarcoding.org

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
Assessing the shared variation among high-dimensional data matrices: a modified version of the Procrustean correlation coefficient
Date Crossref
14/11/2019
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude et ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Institutions déclarées

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Sujets associés

Gene expression and cancer classificationBioinformatics and Genomic NetworksMicrobial Community Ecology and Physiology

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