Chromosome-level genome reference of Venturia effusa , causative agent of pecan scab
Rattachement africain : nz, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract Pecan scab, caused by Venturia effusa , is a devastating disease of pecan ( Carya illinoinensis ), which results in economic losses on susceptible cultivars throughout the southeastern U.S. To enhance our understanding of pathogenicity in V. effusa , we have generated a complete telomere-to-telomere genome reference of V. effusa isolate FRT5LL7-Albino. By combining Illumina MiSeq and Oxford Nanopore MinION data, we assembled a 45.2 Mb genome represented by 20 chromosomes and containing 10,820 genes, of which 7,619 have at least one functional annotation. The likely causative mutation of the albino phenotype was identified as a single base insertion and a resulting frameshift in the gene encoding the polyketide synthase ALM1 . This genome represents the first full chromosome level assembly of any Venturia species.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé, mais le titre doit être comparé manuellement.
- Titre Crossref
- Chromosome-level genome reference of <i>Venturia effusa</i> , causative agent of pecan scab
- Date Crossref
- 24/08/2019
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Massey University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Noble Research Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
Agricultural Research Service pays non établi dans la noticeOrganisme public
-
United States Department of Agriculture pays non établi dans la noticeOrganisme public
-
Southeastern Fruit and Tree Nut Research Laboratory pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
School of Fundamental Sciences and the Bio-Protection Research Centre pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Massey University, Noble Research Institute et Agricultural Research Service, avec 3 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.