Biochemical and structural investigation of taurine:2-oxoglutarate aminotransferase from Bifidobacterium kashiwanohense
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Abstract Taurine aminotransferases catalyze the first step in taurine catabolism in many taurine-degrading bacteria and play an important role in bacterial taurine metabolism in the mammalian gut. Here, we report the biochemical and structural characterization of a new taurine:2-oxoglutarate aminotransferase from the human gut bacterium Bifidobacterium kashiwanohense (BkToa). Biochemical assays revealed high specificity of BkToa for 2-oxoglutarate as the amine acceptor. The crystal structure of BkToa in complex with pyridoxal 5′-phosphate (PLP) and glutamate was determined at 2.7 Å resolution. The enzyme forms a homodimer, with each monomer exhibiting a typical type I PLP-enzyme fold and conserved PLP-coordinating residues interacting with the PLP molecule. Two glutamate molecules are bound in sites near the predicted active site and they may occupy a path for substrate entry and product release. Molecular docking reveals a role for active site residues Trp21 and Arg156, conserved in Toa enzymes studied to date, in interacting with the sulfonate group of taurine. Bioinformatics analysis shows that the close homologs of BkToa are also present in other anaerobic gut bacteria.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- Biochemical and structural investigation of taurine:2-oxoglutarate aminotransferase from <i>Bifidobacterium kashiwanohense</i>
- Date Crossref
- 11/06/2019
- Éditeur
- Portland Press Ltd.
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Tianjin University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Agency for Science pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Institute of Chemical and Engineering Sciences pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Nanjing University of Chinese Medicine Key Laboratory of Drug Targets and Drug Leads for Degenerative Diseases pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Illinois Urbana-Champaign pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Pharmaceutical Science and Technology Tianjin Key Laboratory for Modern Drug Delivery & High-Efficiency pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Metabolic Engineering Research Laboratory pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of Illinois at Urbana-Champaign Department of Chemical and Biomolecular Engineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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