Genomic and epidemiological evidence of a dominant Panton-Valentine leucocidin-positive Methicillin Resistant Staphylococcus aureus lineage in Sri Lanka with spread to the United Kingdom and Australia
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Le résumé fourni par la source
Abstract Objective To undertake the first detailed genomic analysis of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolated in Sri Lanka. Methods A prospective observational study was performed on 94 MRSA isolates collected over a four month period from the Anuradhapura Teaching Hospital, Sri Lanka. Screening for mec A, mec C and the Panton-Valentine leucocidin (PVL)-associated lukS-PV/lukF-PV genes and molecular characterisation by spa typing was undertaken. Whole genome sequencing (WGS) and phylogenetic analysis was performed on selected multilocus sequence type (MLST) clonal complex 5 (CC5) isolates from Sri Lanka, England, Australia and Argentina. Results All 94 MRSA harboured the mecA gene. Nineteen spa types associated with nine MLST clonal complexes were identified. Most isolates were from skin and soft tissue infections (76.9%), with the remainder causing more invasive disease. Sixty two (65.9%) of isolates were PVL positive with the majority (56 isolates; 90.3%) belonging to a dominant CC5 lineage. This lineage, PVL-positive ST5-MRSA-IVc, was associated with community and hospital-onset infections. Based on WGS, representative PVL-positive ST5-MRSA-IVc isolates from Sri Lanka, England and Australia formed a single phylogenetic clade, suggesting wide geographical circulation. Conclusions We present the most detailed genomic analysis of MRSA isolated in Sri Lanka to date. The analysis identified a PVL-positive ST5-MRSA-IVc that dominates MRSA clinical infections in Sri Lanka. Furthermore, transmission of the strain has occurred in the United Kingdom and Australia.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- Genomic and epidemiological evidence of a dominant Panton-Valentine leucocidin-positive Methicillin Resistant <i>Staphylococcus aureus</i> lineage in Sri Lanka with spread to the United Kingdom and Australia
- Date Crossref
- 17/01/2019
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
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Où se fait cette recherche
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Public Health England pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Florey Institute of Neuroscience and Mental Health pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of Sheffield The Florey Institute for Host-Pathogen Interactions and Department of Infection pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust Dept of Microbiology pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Murdoch University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Universidad El Bosque pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Texas Health Science Center at Dallas pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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The University of Texas Health Science Center pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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National Center for Infectious Diseases pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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The University of Texas Health Science Center at Houston pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Rajarata University of Sri Lanka pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Fleming College pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Public Health England, Florey Institute of Neuroscience and Mental Health et The Florey Institute for Host-Pathogen Interactions and Department of Infection — University of Sheffield, avec 9 autres affiliations.
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