Molecular Diversity of Hepatitis B Virus X Gene in Central Kerala, Southern India
Rattachement africain : in. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Introduction: Hepatitis B Virus (HBV) causes diverse clinical manifestations ranging from acute fulminant Hepatitis, Chronic Hepatitis (CHB) to liver cirrhosis and Haepatocellular Carcinoma (HCC). The HBV X gene (HBV-X) is a 154 amino acid multifunctional protein, mutates frequently and has a role in HBV related HCC. Aim: The current study was to explore the genetic variability and identify mutations of HBV-X in CHB patients from Central Kerala, India. Materials and Methods: The HBV-X sequences (n=39) from CHB (n=90) patients were analysed for nucleotide and amino acid diversity. Phylogenetic analyses were done using MEGA version 7.0.21 software to determine different genotypes. Results: Basal Core Promoter (BCP) mutations: A1762T/ G1764A (n=5) were found in HBeAg negative subjects (n=3, 60%). Bioinformatic analysis showed that the substitutions and mutations were HBV genotype/subgenotype specific. The predominant genotype detected was A1 (n=52, 57.77%) followed by genotype D (n=27, 30.00%). Nucleotide and amino acid diversities were more in genotype A1 than in D, which is responsible for transactivation (p<0.0001), those infected with this genotype may be at high risk for HCC. Conclusion: Genotype A1 isolates displayed most mutations/ substitutions in HBV-X, Further studies are necessary to understand its role in contributing to the development of HCC. The study represents the first formal investigation of HBV-X genetic variability in Kerala.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Molecular Diversity of Hepatitis B Virus X Gene in Central Kerala, Southern India
- Date Crossref
- 01/01/2018
- Éditeur
- JCDR Research and Publications
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Amrita Institute of Medical Sciences and Research Centre pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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HLL Lifecare (India) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Vellore Institute of Technology University Centre for Bio Separation Technology (CBST) pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Pushpagiri Medical College pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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International Clinical Epidemiology Network Scientist pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Amrita University Department of Clinical Virology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Scientist E pays non établi dans la noticeInstitution
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Pushpagiri Institute of Medical Sciences and Research Centre Department of Gastroenterology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Amrita Institute of Medical Sciences and Research Centre, HLL Lifecare (India) et Centre for Bio Separation Technology (CBST) — Vellore Institute of Technology University, avec 5 autres affiliations.
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