Development and validation of an extended database for yeast identification by MALDI-TOF MS in Argentina
Rattachement africain : ar, mx. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) has revolutionized the identification of microorganisms in clinical laboratories because it is rapid, relatively simple to use, accurate, and can be used for a wide number of microorganisms. Several studies have demonstrated the utility of this technique in the identification of yeasts; however, its performance is usually improved by the extension of the database. Here we developed an in-house database of 143 strains belonging to 42 yeast species in the MALDI Biotyper platform, and we validated the extended database with 388 regional strains and 15 reference strains belonging to 55 yeast species. We also performed an intra- and interlaboratory study to assess reproducibility and analyzed the use of the cutoff values of 1.700 and 2.000 to correctly identify at species level. The creation of an in-house database that extended the manufacturer's database was successful in view of no incorrect identification was introduced. The best performance was observed by using the extended database and a cutoff value of 1.700 with a sensitivity of .94 and specificity of .96. A reproducibility study showed utility to detect deviations and could be used for external quality control. The extended database was able to differentiate closely related species and it has potential in distinguishing the molecular genotypes of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Development and validation of an extended database for yeast identification by MALDI-TOF MS in Argentina
- Date Crossref
- 11/05/2018
- Éditeur
- Oxford University Press (OUP)
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Hospital de Especialidades pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Hospital Fernández pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas Norberto Quirno pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Hospital de Clínicas "José de San Martín" pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Hospital Alemán pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas “Dr. Carlos G. Malbrán Departamento Micología pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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División Micología pays non établi dans la noticeInstitution
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Centro de Especialidades Médicas Ambulatorias de Rosario pays non établi dans la noticeInstitution
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Hospital General de Agudos “Dr. Juan A. Fernández” Ciudad Autónoma de Buenos Aires pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas “Norberto Quirno pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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BD Diagnostics Systems pays non établi dans la noticeInstitution
Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud, Hospital de Especialidades et Hospital Fernández, avec 9 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.