A genetic delineation of Patchouli (Pogostemon cablin) revealed by specific‐locus amplified fragment sequencing
Rattachement africain : cn, ch. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
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Abstract Patchouli plant (Pogostemon cablin (Blanco) Benth.) is of important economic value, and it has been grown for medicinal use for more than 1000 years in China and Southeast Asia. There are limited data to underpin the genetic and genomic resource management for Patchouli. Herein, we used specific‐locus amplified fragment sequencing to generate a genetic delineation of P. cablin collected from Vietnam, South China, and Indonesia (Sumatra). In total, 15 457 835 reads, 61 334 specific‐locus amplified fragments, and 511 reliable single nucleotide polymorphisms were obtained. On the basis of model‐based grouping and neighbor‐joining trees, we divided the studied accessions into six distinct groups: one Vietnamese group, two Chinese groups, and three Indonesian groups. We also measured the contents of patchouli alcohol and pogostone; all accessions belonged to patchoulol‐type except for three accessions from the species' northernmost distribution in China, which have a high content of pogostone. The results from both genetic structure and chemotypes were highly consistent with the possible migration history of Patchouli. Accordingly, ex situ conservation should be immediately established for Patchouli, particularly for the pogostone‐type and the germplasm in Vietnam.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- A genetic delineation of Patchouli (<i>Pogostemon cablin</i>) revealed by specific‐locus amplified fragment sequencing
- Date Crossref
- 10/03/2016
- Éditeur
- Wiley
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Beijing Botanical Garden pays non établi dans la noticeInstitution
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South China Botanical Garden pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Firmenich (Switzerland) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Chinese Academy of Sciences pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Shanghai Institutes for Biological Sciences pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Center for Excellence in Molecular Plant Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Key Laboratory of Plant Resources Conservation and Sustainable Utilization pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Ltd. Shanghai 201108 China Research and Development Centre Firmenich Aromatics (China) Co. pays non établi dans la noticeEntreprise
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National Key Laboratory of Plant Molecular Genetics pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Beijing Botanical Garden, South China Botanical Garden et Firmenich (Switzerland), avec 6 autres affiliations.
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