Identification of a new subclass of ALK-negative ALCL expressing aberrant levels of ERBB4 transcripts
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Le résumé fourni par la source
Anaplastic large-cell lymphoma (ALCL) is a clinical and biological heterogeneous disease that includes systemic anaplastic lymphoma kinase (ALK)-positive and ALK-negative entities. To discover biomarkers and/or genes involved in ALK-negative ALCL pathogenesis, we applied the cancer outlier profile analysis algorithm to a gene expression profiling data set including 249 cases of T-cell non-Hodgkin lymphoma and normal T cells. Ectopic coexpression of ERBB4 and COL29A1 genes was detected in 24% of ALK-negative ALCL patients. RNA sequencing and 5' RNA ligase-mediated rapid amplification of complementary DNA ends identified 2 novel ERBB4-truncated transcripts displaying intronic transcription start sites. By luciferase assays, we defined that the expression of ERBB4-aberrant transcripts is promoted by endogenous intronic long terminal repeats. ERBB4 expression was confirmed at the protein level by western blot analysis and immunohistochemistry. Lastly, we demonstrated that ERBB4-truncated forms show oncogenic potentials and that ERBB4 pharmacologic inhibition partially controls ALCL cell growth and disease progression in an ERBB4-positive patient-derived tumorgraft model. In conclusion, we identified a new subclass of ALK-negative ALCL characterized by aberrant expression of ERBB4-truncated transcripts carrying intronic 5' untranslated regions.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Identification of a new subclass of ALK-negative ALCL expressing aberrant levels of ERBB4 transcripts
- Date Crossref
- 14/01/2016
- Éditeur
- American Society of Hematology
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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University of Turin Department of Molecular Biotechnology and Health Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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SIB Swiss Institute of Bioinformatics pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Dalle Molle Institute for Artificial Intelligence Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institute of Oncology Research Lymphoma and Genomics Research Program pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of Milan Department of Clinical Sciences and Community Health pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Ospedale Maggiore Hematology Unit pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Columbia University Department of Biomedical Informatics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Azienda Ospedaliera Citta' della Salute e della Scienza di Torino pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Cornell University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Perugia Institute of Hematology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Italian institute for Genomic Medicine pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
Department of Molecular Biotechnology and Health Sciences — University of Turin, SIB Swiss Institute of Bioinformatics et Dalle Molle Institute for Artificial Intelligence Research, avec 9 autres affiliations.
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