CAFE: an R package for the detection of gross chromosomal abnormalities from gene expression microarray data
Rattachement africain : nl, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
SUMMARY: The current methods available to detect chromosomal abnormalities from DNA microarray expression data are cumbersome and inflexible. CAFE has been developed to alleviate these issues. It is implemented as an R package that analyzes Affymetrix *.CEL files and comes with flexible plotting functions, easing visualization of chromosomal abnormalities. AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: CAFE is available from https://bitbucket.org/cob87icW6z/cafe/ as both source and compiled packages for Linux and Windows. It is released under the GPL version 3 license. CAFE will also be freely available from Bioconductor. CONTACT: sander.h.bollen@gmail.com or nancy.mah@mdc-berlin.de SUPPLEMENTARY INFORMATION: Supplementary data are available at Bioinformatics online.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- CAFE: an R package for the detection of gross chromosomal abnormalities from gene expression microarray data
- Date Crossref
- 21/01/2014
- Éditeur
- Oxford University Press (OUP)
- Type
- journal-article
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Les institutions déclarées
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