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Accès ouvert déclaré 2011 article

thermo-msf-parser: An Open Source Java Library to Parse and Visualize Thermo Proteome Discoverer msf Files

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4Institutions déclarées
3Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : be, no, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

The Thermo Proteome Discoverer program integrates both peptide identification and quantification into a single workflow for peptide-centric proteomics. Furthermore, its close integration with Thermo mass spectrometers has made it increasingly popular in the field. Here, we present a Java library to parse the msf files that constitute the output of Proteome Discoverer. The parser is also implemented as a graphical user interface allowing convenient access to the information found in the msf files, and in Rover, a program to analyze and validate quantitative proteomics information. All code, binaries, and documentation is freely available at http://thermo-msf-parser.googlecode.com.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé, mais le titre doit être comparé manuellement.

Titre Crossref
thermo-msf-parser: An Open Source Java Library to Parse and Visualize Thermo Proteome Discoverer <i>msf</i> Files
Date Crossref
11/07/2011
Éditeur
American Chemical Society (ACS)
Type
journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • Ghent University Department of Biochemistry pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University of Bergen Uni Computing pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Leibniz Institute for Analytical Sciences - ISAS pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Ruhr University Bochum pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Department of Medical Protein Research pays non établi dans la notice
    Institution
  • Leibniz-Institut für Analytische Wissenschaften - ISAS–e.V. pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Medizinisches Proteom-Center (MPC) pays non établi dans la notice
    Institution

Department of Biochemistry — Ghent University, Uni Computing — University of Bergen et Leibniz Institute for Analytical Sciences - ISAS, avec 4 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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