Pichia sorbitophila, an Interspecies Yeast Hybrid, Reveals Early Steps of Genome Resolution After Polyploidization
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Polyploidization is an important process in the evolution of eukaryotic genomes, but ensuing molecular mechanisms remain to be clarified. Autopolyploidization or whole-genome duplication events frequently are resolved in resulting lineages by the loss of single genes from most duplicated pairs, causing transient gene dosage imbalance and accelerating speciation through meiotic infertility. Allopolyploidization or formation of interspecies hybrids raises the problem of genetic incompatibility (Bateson-Dobzhansky-Muller effect) and may be resolved by the accumulation of mutational changes in resulting lineages. In this article, we show that an osmotolerant yeast species, Pichia sorbitophila, recently isolated in a concentrated sorbitol solution in industry, illustrates this last situation. Its genome is a mosaic of homologous and homeologous chromosomes, or parts thereof, that corresponds to a recently formed hybrid in the process of evolution. The respective parental contributions to this genome were characterized using existing variations in GC content. The genomic changes that occurred during the short period since hybrid formation were identified (e.g., loss of heterozygosity, unilateral loss of rDNA, reciprocal exchange) and distinguished from those undergone by the two parental genomes after separation from their common ancestor (i.e., NUMT (NUclear sequences of MiTochondrial origin) insertions, gene acquisitions, gene location movements, reciprocal translocation). We found that the physiological characteristics of this new yeast species are determined by specific but unequal contributions of its two parents, one of which could be identified as very closely related to an extant Pichia farinosa strain.
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- Titre Crossref
- <i>Pichia sorbitophila</i>, an Interspecies Yeast Hybrid, Reveals Early Steps of Genome Resolution After Polyploidization
- Date Crossref
- 01/02/2012
- Éditeur
- Oxford University Press (OUP)
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Génétique Moléculaire Génomique Microbiologie pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Université de Strasbourg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Université de Bordeaux pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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AgroParisTech pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Université Paris-Sud Institut de Génétique et Microbiologie pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Commissariat à l'Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives pays non établi dans la noticeOrganisme public
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CEA Paris-Saclay pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Institut de Biologie et Technologies pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Architecture et Réactivité de l'arN pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Centre National de la Recherche Scientifique, Génétique Moléculaire Génomique Microbiologie et Université de Strasbourg, avec 9 autres affiliations.
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