Characterization of the OmyY1 Region on the Rainbow Trout Y Chromosome
Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
We characterized the male-specific region on the Y chromosome of rainbow trout, which contains both sdY (the sex-determining gene) and the male-specific genetic marker, OmyY1. Several clones containing the OmyY1 marker were screened from a BAC library from a YY clonal line and found to be part of an 800 kb BAC contig. Using fluorescence in situ hybridization (FISH), these clones were localized to the end of the short arm of the Y chromosome in rainbow trout, with an additional signal on the end of the X chromosome in many cells. We sequenced a minimum tiling path of these clones using Illumina and 454 pyrosequencing. The region is rich in transposons and rDNA, but also appears to contain several single-copy protein-coding genes. Most of these genes are also found on the X chromosome; and in several cases sex-specific SNPs in these genes were identified between the male (YY) and female (XX) homozygous clonal lines. Additional genes were identified by hybridization of the BACs to the cGRASP salmonid 4x44K oligo microarray. By BLASTn evaluations using hypothetical transcripts of OmyY1-linked candidate genes as query against several EST databases, we conclude at least 12 of these candidate genes are likely functional, and expressed.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Characterization of the OmyY1 Region on the Rainbow Trout Y Chromosome
- Date Crossref
- 01/01/2013
- Éditeur
- Wiley
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Washington State University Vancouver Center for Reproductive Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Washington State University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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United States Geological Survey pays non établi dans la noticeOrganisme public
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NOAA National Marine Fisheries Service Northwest Fisheries Science Center pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Western Fisheries Research Center US Geological Survey pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Reed College Biology Department pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Biological Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Center for Reproductive Biology — Washington State University Vancouver, Washington State University et United States Geological Survey, avec 4 autres affiliations.
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